GA/T 1377-2018.Forensic science-Specifications for multiplex SNPs detection for ancestry inference.
1范围
GA/T 1377规定了法庭科学DNA实验室在使用复合SNPs检验进行族群推断时应参照的规范。
GA/T 1377适用于所有开展复合SNPs检验族群推断的法庭科学DNA实验室。
2术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
2.1祖先信息标记ancestry informative markers ;A IMs
在不同族群之间存在较大频率分布差异的一-组SNPs位点。
2.2族群population
在体质形态上具有某些共同遗传特征的人类群体。
2.3怀特氏F统计量Wright's F-statistic
也称固定系数(fixation index),对群体亚结构的一种度量方法,通过杂合度的计算，分析每一个位点在所有亚群体中的变异程度。
注:Wright'sF值的大小反映了每个位点的等位基因频率在不同群体中的变化程度.值越小,说明变异程度越小;相反,值越大，说明变异程度越大。
2.4 祖先成分ancestry component
样本可能的祖先来源所占的成分比例。
3技术要求
3.1 方法组成
由于族群分化复杂,很难使用一个体系实现所有族群的推断区分,一般使用等级化推断的方法,先用少量位点实现大族群的推断,然后使用更多位点的组合实现不同亚群的推断。
用于族群推断的方法体系应包括:推断说明、位点组合、检测体系、AIMs数据库、推断算法、判读标
准。各族群推断体系需根据体系特点确定最低SNP位点数量。
3.2 待推断族群说明
一种方法体系首先需要说明该方法所针对的目标族群,包括:族群的名称、分布信息。
GA/T 1377-2018 法庭科学复合SNPs检验族群推断方法
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